Ifølge skriftlige kilder ble byen grunnlagt i 1070, men det er indikasjoner på at en bosetning med bymessige trekk var til stede i den nordlige delen av Bryggen-området før den datoen. Synlige rester av middelalderbyen er kirker, kirkeruiner og deler av enkelte stående bygninger, for eksempel noen av steinkjellerne bak verdensarvstedet Bryggen. Bryggen bevarer et bebyggelsesmønster som går tilbake til den tidlig middelalderske perioden, lenge før Hanseatenes inntog, og enkelte av dagens bygater deler trasé med middelalderens gater.

Middelalderbyen Bergen rommer et veldig stort volum av arkeologiske avsetninger («kulturlag»), hvorav mange har et høyt innhold av organisk materiale. Slikt materiale er sårbart for nedbrytningsprosesser, og i mange områder er det derfor blitt iverksatt miljøovervåkingsprosjekter for å få tak i mest mulig informasjon om forholdene under bakken.

Her finner du NIKU Bergen

NIKUs bergenskontor holder til i 4. etasje på Bryggens Museum, og er samlokalisert med viktige deler av middelaldermiljøet i Bergen.